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药用植物生态学主要研究药用植物生长发育与生态环境的关系，还研究环境对药用植物质量与产量的影响。药用植物在长期进化过程受多种因素，如区系地理起源、气候土壤、地质背景、其所在群落以及生态系统，甚至运输、市场经济、文化等人为因素的影响。下面就来说说三叶青的生态学理论知识。
(1)生态位原理
英国生态学家C.E.Hutchinson提出生态位是种在多维空间中的适合性去确定物种所占有的微环境的边界。E.P.Odum认为生态位在群落中功能作用、湿度、温度、土壤和其他生存条件的环境变化梯度中的位置。当两种物种利用同一种资源和空间时产生的种间竞争现象；当两种物种同一环境中占据不同空间和营养物质时产生的种间共生现象；当多种物种在同一环境资源中相互有效利用资源，达到长期稳定共存；在稳定的生态环境中，植物对稳定生态环境的适应可导致对资源的选择性加强。因此，中药材三叶青植物适合种植于稳定的生态环境中，存在多个物种群组成的生物群落能有效地利用森林环境资源，维持长期高生产力、更大的稳定性。
(2)生态平衡原理
生态平衡是生态系统的一种良好状态。在一定的时间和相对稳定的条件下，生态系统内生物、环境以及人的结构和功能均处于相互适应与协调的动态平衡。生物多样性是保持生态系统稳定性的重要条件。生态系统的生物种类越多，遗传基因库越丰富，食物链越复杂，能力和营养物质的贮备越多，自我调节能力越强。多种物种在一起相生相克，保持系统稳定。自然生态系统是一个相当和谐、协调、有序的大系统。因此，三叶青资源选择在生物种类繁多的针阔叶混交林中生存，减少病虫的危害，增强三叶青的品质，提高三叶青产业化的开放力度。
